大围山杓兰2005年初发现时，曾经被命名为丽江杓兰的变种（Cypripedium lichiangenseS.C.Chen & P.J.Cribb variety daweishanenseS.C.Chen & Z.J.Liu），2013年被认为是一个独立物种，并被列入《世界自然保护联盟》（IUCN） 。